Episodio 1

Érase una vez una raza conocida como los Ángeles de la Sombra que atacó la Tierra para cosechar la fuerza vital de todos los que habitaban el planeta. Gracias a un milagro extraordinario, los Ángeles de la Sombra entraron en un estado de hibernación, y la humanidad pudo vivir otros 12,000 años sin temer su presencia. Pero 11 años después de una catástrofe apodada la Sagrada Génesis que trajo ruina a la Tierra, los Ángeles de la Sombra fueron despertados de su letargo y reanudaron los ataques una vez más. Para darle a la humanidad algo de oportunidad, se formó una organización conocida como DEAVA, y se autorizó el uso de una arma robótica llamada Aquarion. Para que el Aquarion alcance su máximo poder, tres pilotos deben combinar sus corazones, cuerpos y almas en uno solo, una hazaña que pocos pueden esperar lograr. Así, la búsqueda de los llamados 'Usuarios de Elementos' se volvió una prioridad, con la esperanza de asegurar el futuro de la humanidad. Sousei no Aquarion sigue la historia de Apolo, un joven casi salvaje criado en la pobreza, que se cree que es un héroe legendario reencarnado. Después de que su mejor amigo es capturado por los Ángeles de la Sombra, Apolo elige convertirse en piloto de Aquarion. ¿Podrá cambiar el rumbo de la guerra y liberar a la humanidad de la amenaza de los Ángeles de la Sombra de una vez por todas?