Episodio 1
El año es 2045, y la inteligencia artificial ha experimentado enormes desarrollos. Los gobiernos las utilizan como armas, involucrándose en guerras interminables para sustentar sus economías. El grupo mercenario GHOST, encabezado por la Mayor Motoko Kusanagi, no es ajeno a este panorama. Sin embargo, la rápida innovación de esta tecnología provoca que una nueva amenaza se cierna en el horizonte. Habiendo dejado la Sección de Seguridad Pública 9, Kusanagi y su grupo están involucrados en numerosas operaciones en todo el mundo relacionadas con estas guerras por poder. Pero un trabajo aparentemente simple de localizar a un traficante de armas arrastra a GHOST a un conflicto oculto contra individuos mejorados cibernéticamente, que han obtenido injustificadamente inteligencia extrema y habilidades físicas. Llamados "post-humanos", su aparición desencadena una serie de eventos que conducen a la reunión de la Sección 9. Armados con una nueva misión, depende de Kusanagi y su equipo restablecido prevenir el caos global a manos de estos post-humanos.