Episodio 1

Ambientada en el año 2029 y tras las Guerras Mundiales III y IV, un bloque asiático liderado por Japón domina los asuntos mundiales. La alianza mantiene su supremacía internacional a través de su fuerza de seguridad de élite, cuyos operativos cibernéticamente mejorados enfrentan una variedad de terroristas de alta tecnología y otras amenazas a la seguridad internacional. Estos agentes aumentados pueden "hackear fantasmas" (es decir, descargar su consciencia) a través de la ahora omnipresente internet en otras máquinas y híbridos humano/máquina. La Mayor Motoko Kusanagi, una agente femenina cibernéticamente aumentada, ha estado rastreando una entidad virtual conocida como el Maestro de Marionetas con su equipo de élite de agentes de seguridad. El Maestro de Marionetas, una creación rebelde de una agencia rival del aparato de seguridad, ha llegado a la conclusión de que es una forma de vida por derecho propio, "nacida en un mar de información," y ha solicitado asilo político y una verdadera existencia física desafiando a sus creadores.