Episodio 1
U.C. 0097, un año después de la apertura de "La Caja de Laplace." A pesar de la revelación de la Carta del Siglo Universal que reconoce la existencia y los derechos de los Newtypes, el marco del mundo no ha cambiado considerablemente. El conflicto que más tarde se apodó como el "Incidente de Laplace" se piensa que terminó con la caída de los restos de Neo Zeon conocidos como los Sleeves. En su batalla final, dos móviles de combate equipados con psycho-frame mostraron un poder más allá de la comprensión humana. El unicornio blanco y el león negro fueron sellados para eliminar este peligro de la conciencia de las personas, y ahora deberían ser completamente olvidados. Sin embargo, el RX-0 Unicorn Gundam 03, que desapareció dos años antes, está a punto de mostrarse en la Esfera terrestre una vez más. Un fénix dorado... llamado Phenex.