Los invasores robóticos exterminaron toda forma de vida, pero Renge lucha por sobrevivir utilizando sus poderes. Sin recuerdos, deambula por la ciudad hasta que conoce a cinco jóvenes más, cada una con habilidades únicas. Juntas, aprovechan al máximo sus vidas, cocinando deliciosas comidas entre batallas con monstruos mecánicos. A medida que descubren los secretos de sus poderes y pasados, encuentran fortaleza en su amistad.
Hace cincuenta años, criaturas misteriosas conocidas como los "Gigantes" aparecieron de repente en todo el mundo, representando una amenaza existencial para la humanidad. Para defenderse de estas amenazas, soldados en forma de chicas adolescentes conocidas como "Lirios" utilizan la energía "Magie" dentro de sus cuerpos para activar armas llamadas "Counter Huge ARMS" o "CHARMS". Después de ser salvada por un Lirio hace dos años durante una evacuación de un ataque Gigante, Riri Hitotsuyanagi juró convertirse en Lirio ella misma. Se inscribe en la prestigiosa academia de Yurigaoka, un campo de entrenamiento para Lirios, y descubre que una de sus compañeras de clase es Yuyu Shirai, la misma Lirio que la rescató. Sin embargo, para su confusión, la persona que ella pensaba que era alegre resulta ser bastante antisocial y prefiere pelear sola. Aún así, Riri desea llevarse bien con Yuyu y está dispuesta a hacer lo que sea necesario para alcanzar ese objetivo. Con Yuyu y los otros Lirios a su lado, el viaje de Riri para convertirse en uno de ellos apenas ha comenzado a florecer.
Las chicas del Club de Diversiones regresan en Yuru Yuri♪♪, encontrando nuevas maneras de hacer que el tiempo pase de manera aún más agradable. Sus miembros están compuestos por la siempre enérgica Kyouko Toshinou; la calma y sensata Yui Funami; la educada pero a menudo pasada por alto Akari Akaza; y Chinatsu Yoshikawa, quien se topó con las otras mientras buscaba el Club de Ceremonia del Té. Juntas forman el Club de Diversiones, que tiene la aparentemente simple tarea de mantener entretenidos a sus miembros. Junto con el Consejo Estudiantil y algún que otro miembro de la familia, se esfuerzan por disfrutar de su juventud al máximo. Ya sea un viaje a un onsen o terminar tareas atrasadas, sus vidas nunca son aburridas, y siempre encontrarán una excusa para pasar tiempo juntas.
Después de un año en la escuela primaria sin sus amigos de la infancia, la estudiante de primer año Akari Akaza finalmente se reúne con las alumnas de segundo año Yui Funami y Kyouko Toshinou en su escuela secundaria femenina. Durante el primer año de la dupla, Yui y Kyouko formaron el "Club de Entretenimiento", que ocupa la ahora inexistente sala del Club de Té. Poco después de que Akari se une, una de sus compañeras de clase, Chinatsu Yoshikawa, les hace una visita con la impresión de que son el Club de Té; solo una vez que las tres chicas explican que el Club de Té ha sido disuelto, pueden convencer a Chinatsu para que se una al Club de Entretenimiento, un grupo sin otro propósito que ofrecer entretenimiento a sus miembros. Basado en el manga slice-of-life de Namori, Yuru Yuri es una comedia excéntrica sobre un grupo de chicas que pasan su tiempo libre tomando té y admirándose mutuamente, todo mientras no logran notar a la supuesta protagonista, Akari, entre ellas.
